21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0018 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0018  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  654  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  6.71428e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2488  hypothetical protein  70.29 
 
 
331 aa  446  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  9.14073e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0858  hypothetical protein  66.99 
 
 
329 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2899  hypothetical protein  70.57 
 
 
333 aa  424  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1573  hypothetical protein  65.43 
 
 
329 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1194  hypothetical protein  66.56 
 
 
345 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  normal  0.262929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2845  hypothetical protein  68.39 
 
 
338 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00165169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3230  hypothetical protein  68.81 
 
 
319 aa  418  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283864  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1817  hypothetical protein  68.06 
 
 
329 aa  415  1e-115  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.172258  normal  0.343692 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2228  hypothetical protein  65.52 
 
 
328 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.508663  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1140  hypothetical protein  66.88 
 
 
329 aa  406  1e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1337  hypothetical protein  67 
 
 
333 aa  407  1e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2364  hypothetical protein  69.09 
 
 
329 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0327  hypothetical protein  64.24 
 
 
314 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.739831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0765  hypothetical protein  66.67 
 
 
329 aa  400  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1665  hypothetical protein  66.34 
 
 
329 aa  399  1e-110  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1631  hypothetical protein  66.34 
 
 
329 aa  399  1e-110  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1664  hypothetical protein  59.61 
 
 
334 aa  356  4e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0858  hypothetical protein  53.89 
 
 
352 aa  342  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.364297  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0714  hypothetical protein  56.07 
 
 
349 aa  335  6e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0285775  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3788  putative seryl-tRNA synthetase (serine--tRNA ligase) (SerRS)  55.41 
 
 
313 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>