71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0015 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
173 aa  352  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.73 
 
 
180 aa  107  7e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  32.64 
 
 
178 aa  84  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
179 aa  82.4  3e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 
180 aa  76.3  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 
186 aa  72.8  2e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 
185 aa  72.4  3e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 
185 aa  72.4  3e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.63 
 
 
185 aa  72.4  3e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  27.98 
 
 
173 aa  71.2  6e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  34.73 
 
 
190 aa  70.5  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.74 
 
 
187 aa  67  1e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 
187 aa  67.4  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 
176 aa  65.1  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  29.34 
 
 
176 aa  64.7  5e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  29.34 
 
 
176 aa  64.7  5e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  29.34 
 
 
176 aa  64.7  5e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  27.11 
 
 
176 aa  64.7  6e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
220 aa  63.9  1e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 
176 aa  63.2  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 
176 aa  63.2  2e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 
176 aa  63.2  2e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  30.49 
 
 
189 aa  63.5  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
194 aa  62.4  3e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
190 aa  62  4e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 
193 aa  58.9  4e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
193 aa  55.8  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.76 
 
 
178 aa  56.6  2e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  21.09 
 
 
174 aa  56.6  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 
179 aa  55.5  3e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  21.99 
 
 
170 aa  55.5  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  29.73 
 
 
149 aa  55.5  4e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  24.5 
 
 
183 aa  55.1  5e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.78 
 
 
186 aa  55.1  5e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.82 
 
 
180 aa  54.3  8e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  23.4 
 
 
186 aa  53.5  2e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  28.07 
 
 
194 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  25.77 
 
 
217 aa  52  4e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
189 aa  51.6  5e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  22.03 
 
 
177 aa  51.2  7e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  49.3  2e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  23.39 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  24.51 
 
 
188 aa  48.9  4e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  24.83 
 
 
211 aa  48.9  4e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  23.97 
 
 
184 aa  48.1  6e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 
181 aa  48.1  7e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
180 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
178 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  27.56 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  23.64 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  24.77 
 
 
204 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  21.25 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  21.25 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.29 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  22.96 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  21.25 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  23.23 
 
 
207 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.73 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  19.09 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
172 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.02 
 
 
210 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  22.22 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  22.58 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  23.88 
 
 
234 aa  40.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  20 
 
 
200 aa  40.8  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.42 
 
 
185 aa  40.8  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32 
 
 
172 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>