26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0012 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  100 
 
 
565 aa  1144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  29.34 
 
 
614 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  25.83 
 
 
552 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  25.6 
 
 
554 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  25.41 
 
 
535 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  4.10606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  24.28 
 
 
558 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  23.37 
 
 
561 aa  138  3e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  26.92 
 
 
505 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  25.51 
 
 
555 aa  137  6e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  26.93 
 
 
568 aa  113  8e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  26.26 
 
 
510 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  28.32 
 
 
476 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  26.74 
 
 
498 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7001e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  24.83 
 
 
510 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.73547e-11  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  27.41 
 
 
492 aa  100  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  26 
 
 
476 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.94552e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  23.54 
 
 
505 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.13286e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  26.55 
 
 
376 aa  84  7e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  34.17 
 
 
888 aa  66.2  1e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  26.92 
 
 
893 aa  60.1  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.29 
 
 
920 aa  57.8  6e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  28.38 
 
 
896 aa  57  8e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.63 
 
 
892 aa  53.9  8e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1261  hypothetical protein  26.73 
 
 
506 aa  52  3e-05  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  2.14476e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 
895 aa  51.6  4e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 
895 aa  43.5  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>