More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0010 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  48 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  45.05 
 
 		 95 aa  90.9  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  41.82 
 
 		 122 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 106 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  40.59 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  39.66 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 94 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  29.69 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 134 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  43.33 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  31.34 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34.71 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  32.38 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 127 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  32.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  32.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  32.8 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  37 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  34.92 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  35.59 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  39.77 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  34.96 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  32.28 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  32.67 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  34.86 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  38.46 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  32.5 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  33.93 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  34.43 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  30.61 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  31.9 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  30.09 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 135 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  31.53 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  33.04 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>