17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0008 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0008  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  640  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  33.2 
 
 
325 aa  133  4e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3676  hypothetical protein  29.02 
 
 
314 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2762  hypothetical protein  31.27 
 
 
314 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2609  hypothetical protein  26.72 
 
 
317 aa  80.9  2e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.051078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1478  hypothetical protein  29.32 
 
 
317 aa  80.1  5e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00443079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2842  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  73.9  4e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.39293e-08  hitchhiker  1.78909e-13 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0667  hypothetical protein  29.47 
 
 
314 aa  72.8  8e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.37864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1997  hypothetical protein  26.48 
 
 
318 aa  71.2  2e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0760  hypothetical protein  27.43 
 
 
322 aa  66.6  5e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.14648e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2213  hypothetical protein  29.61 
 
 
300 aa  51.6  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0022  hypothetical protein  23.55 
 
 
352 aa  50.8  3e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0276256  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2444  hypothetical protein  33.11 
 
 
304 aa  49.7  7e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2821  hypothetical protein  33.11 
 
 
193 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2459  hypothetical protein  29.66 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.190883 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3304  membrane protein-like protein  23.04 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0131  membrane protein-like  26.02 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0867832  normal  0.324559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>