More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0007 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  300  5e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  46.26 
 
 
199 aa  115  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  41.55 
 
 
160 aa  114  7e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  47.97 
 
 
148 aa  111  4e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
167 aa  110  8e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 
202 aa  109  1e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 
149 aa  106  9e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  37.33 
 
 
170 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
149 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
153 aa  104  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  43.62 
 
 
149 aa  104  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
149 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 
188 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 
197 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 
189 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 
149 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  9.28974e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  39.47 
 
 
186 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
149 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
168 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
189 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
149 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  44.78 
 
 
210 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  42 
 
 
202 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
189 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 
189 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  43.24 
 
 
151 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0042  ribosomal protein L9  43.33 
 
 
150 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  41.61 
 
 
150 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
209 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 
191 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  41.26 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  42.28 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  41.26 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 
202 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
148 aa  99  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  3.15624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  39.58 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 
167 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.45753e-06  hitchhiker  1.02152e-13 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  38.82 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.73 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  43.24 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.25439e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
191 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 
190 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
171 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.25617e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  36.11 
 
 
195 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  38.16 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
201 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  3.17895e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  38.35 
 
 
198 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
179 aa  95.9  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00703e-05 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  40.6 
 
 
189 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  6.2237e-08 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  35.81 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  38.67 
 
 
150 aa  94.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  39.85 
 
 
189 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.31124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  37.76 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  34.46 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  39.71 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
189 aa  94  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
172 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.22973e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
149 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
147 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
190 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  38.19 
 
 
147 aa  94  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.98897e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
189 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 
195 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
189 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
196 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  40.97 
 
 
211 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 
192 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 
194 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  42.22 
 
 
149 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>