More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0006 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  100 
 
 
471 aa  954  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
445 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  52.13 
 
 
453 aa  453  1e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.02825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  52.36 
 
 
454 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
453 aa  445  1e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.8375e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
453 aa  445  1e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
453 aa  445  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.6604e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
453 aa  446  1e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  9.64148e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
449 aa  447  1e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.00588e-07  hitchhiker  8.05673e-10 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
454 aa  447  1e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  49.55 
 
 
481 aa  448  1e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  446  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
453 aa  445  1e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.93177e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
453 aa  445  1e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.15662e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
453 aa  445  1e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.66895e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  51.25 
 
 
449 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.28284e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
449 aa  441  1e-122  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.02868e-09 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
449 aa  438  1e-122  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  50 
 
 
456 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  50.57 
 
 
448 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.33122e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  49.34 
 
 
456 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  48.53 
 
 
440 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
459 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  48.87 
 
 
450 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.17 
 
 
445 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  46.19 
 
 
456 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.6213e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.75 
 
 
442 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  48.21 
 
 
456 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  47.03 
 
 
458 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  47.63 
 
 
508 aa  415  1e-115  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
481 aa  417  1e-115  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  47.61 
 
 
444 aa  417  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  47.27 
 
 
451 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  46.62 
 
 
444 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  49.09 
 
 
442 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  47.29 
 
 
439 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.99 
 
 
444 aa  415  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  47.64 
 
 
456 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
441 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.58 
 
 
446 aa  408  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  48.12 
 
 
451 aa  405  1e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  48.12 
 
 
451 aa  405  1e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  47.92 
 
 
460 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.15 
 
 
462 aa  400  1e-110  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  46.05 
 
 
468 aa  399  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.2144e-05  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  46.05 
 
 
468 aa  400  1e-110  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  47.62 
 
 
446 aa  400  1e-110  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  46.05 
 
 
468 aa  399  1e-110  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  5.59812e-08  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  46.17 
 
 
468 aa  400  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.91308e-06  hitchhiker  8.17807e-05 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.56 
 
 
447 aa  400  1e-110  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  46.4 
 
 
468 aa  401  1e-110  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.29174e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  47.96 
 
 
465 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  49.08 
 
 
437 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  47.97 
 
 
446 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  45.3 
 
 
472 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  47.39 
 
 
461 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  45.72 
 
 
468 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  48.06 
 
 
450 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
462 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  45.37 
 
 
468 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.42812e-07  unclonable  2.95185e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  45.5 
 
 
468 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.1661e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  44.02 
 
 
468 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.37695e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  45.58 
 
 
454 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  46.26 
 
 
452 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  43.88 
 
 
454 aa  388  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  44.82 
 
 
468 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.32195e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  46.45 
 
 
466 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  43.92 
 
 
468 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.11425e-05  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  43.72 
 
 
513 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  44.82 
 
 
468 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.07977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  44.64 
 
 
466 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  44.64 
 
 
466 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  44.82 
 
 
468 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  3.88708e-12 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  47.91 
 
 
469 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  43.71 
 
 
461 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.15257e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  44.82 
 
 
468 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.04004e-06  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  43.48 
 
 
460 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
462 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  46.28 
 
 
470 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
468 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.03078e-11  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  46.81 
 
 
460 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
471 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  45.05 
 
 
468 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.07576e-05  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
471 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
451 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.04415e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
471 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  43.57 
 
 
468 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  45.8 
 
 
458 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
468 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.721e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  47.19 
 
 
473 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  47.03 
 
 
460 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
471 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.2 
 
 
466 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  47.47 
 
 
460 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>