More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0004 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0004  inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
260 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  53.23 
 
 
266 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.89361e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1219  Inositol-phosphate phosphatase  46.15 
 
 
256 aa  228  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2060  inositol-1(or 4)-monophosphatase  49.57 
 
 
282 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2439  inositol-1-monophosphatase  48.44 
 
 
315 aa  221  1e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1028  inositol monophosphatase  45.8 
 
 
269 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00157763  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  48.47 
 
 
266 aa  215  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  5.50019e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  42.46 
 
 
265 aa  215  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  2.81614e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0128  inositol monophosphatase  46.72 
 
 
258 aa  213  2e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0416  Inositol-phosphate phosphatase  49.79 
 
 
263 aa  214  2e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.98572e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  50.22 
 
 
266 aa  213  3e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10915e-07 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3707  Inositol-phosphate phosphatase  50 
 
 
272 aa  213  3e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  2.52692e-05  hitchhiker  4.65281e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3316  inositol monophosphatase  45.16 
 
 
262 aa  213  3e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.546431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  45.88 
 
 
266 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  46.75 
 
 
259 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.17 
 
 
263 aa  208  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  42.17 
 
 
266 aa  208  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0054  inositol monophosphatase  45.89 
 
 
255 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.56898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0385  Inositol-phosphate phosphatase  43.88 
 
 
272 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.391446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1534  inositol monophosphatase  47.1 
 
 
258 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0685889  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0888  inositol monophosphatase  47.3 
 
 
269 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0122019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  50.24 
 
 
266 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2582  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  49.78 
 
 
273 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0942  inositol-1-monophosphatase  52.94 
 
 
261 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  45.89 
 
 
263 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  45.41 
 
 
268 aa  201  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3296  inositol monophosphatase  43.08 
 
 
254 aa  200  2e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0697  inositol monophosphatase  49.59 
 
 
260 aa  200  2e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.08929e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0983  inositol monophosphatase  46.85 
 
 
270 aa  200  2e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.33675e-08  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  46.43 
 
 
267 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3902  Inositol-phosphate phosphatase  42.08 
 
 
279 aa  199  4e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  45.33 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  45.33 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  45.33 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  42.13 
 
 
263 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  45.33 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  45.33 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  45.33 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  45.54 
 
 
267 aa  198  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  5.60671e-06 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  42.13 
 
 
263 aa  198  8e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  45.74 
 
 
320 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  42.13 
 
 
263 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.98 
 
 
267 aa  197  1e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2273  inositol monophosphatase  41.13 
 
 
266 aa  197  1e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0668825  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1128  inositol-1-monophosphatase  44.16 
 
 
267 aa  197  1e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.768163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3470  Inositol-phosphate phosphatase  48.83 
 
 
265 aa  196  2e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3534  Inositol-phosphate phosphatase  48.83 
 
 
265 aa  196  2e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.050039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  43.85 
 
 
266 aa  197  2e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0780  Inositol-phosphate phosphatase  45.88 
 
 
264 aa  196  2e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  47.11 
 
 
304 aa  196  4e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  44.44 
 
 
363 aa  195  5e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  45.85 
 
 
431 aa  195  5e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3387  inositol-1(or 4)-monophosphatase  48.24 
 
 
264 aa  195  5e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.713561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  42.61 
 
 
266 aa  195  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  44.4 
 
 
268 aa  194  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3449  inositol-phosphate phosphatase  44.09 
 
 
301 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0895511  normal  0.493047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0511  Inositol-phosphate phosphatase  43.32 
 
 
272 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  43.21 
 
 
267 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0756  inositol-1(or 4)-monophosphatase  40.3 
 
 
274 aa  193  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  43.62 
 
 
267 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  43.62 
 
 
267 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  43.62 
 
 
267 aa  193  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  43.21 
 
 
267 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.74 
 
 
273 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1407  inositol monophosphatase  44.44 
 
 
263 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3950  inositol monophosphatase  41.86 
 
 
570 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.176149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  45.74 
 
 
272 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  46.9 
 
 
267 aa  191  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  41.04 
 
 
255 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  42.8 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  46.08 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.20191e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1554  inositol monophosphatase  46.61 
 
 
269 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475053  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  42.69 
 
 
266 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
267 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.52035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  43.7 
 
 
264 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  43.72 
 
 
267 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  42.8 
 
 
267 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.86 
 
 
328 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  47.09 
 
 
268 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  44.44 
 
 
313 aa  189  3e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3553  inositol monophosphatase  44.27 
 
 
266 aa  189  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  43.04 
 
 
259 aa  189  3e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  44.84 
 
 
261 aa  189  3e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  45.87 
 
 
267 aa  189  3e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  6.55872e-06  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3821  inositol monophosphatase  43.03 
 
 
593 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0303328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  44.44 
 
 
322 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  41.98 
 
 
283 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  44.44 
 
 
347 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.42 
 
 
330 aa  188  6e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  41.42 
 
 
272 aa  189  6e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  45.33 
 
 
297 aa  188  6e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  42.86 
 
 
270 aa  188  6e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  42.54 
 
 
268 aa  188  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.61138e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  44.69 
 
 
263 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  46.25 
 
 
270 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0661  Inositol-phosphate phosphatase  44.25 
 
 
265 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.432346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  45.05 
 
 
271 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>