More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_975 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  91.4 
 
 		 189 aa  352  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  91.94 
 
 		 192 aa  351  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  43.37 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  43.37 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  43.2 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  41.24 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  43.02 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  41.9 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  43.56 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  41.86 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  48.2 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  38.95 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  41.76 
 
 		 209 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  40.48 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  40 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  39.46 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  39.46 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  39.46 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  39.46 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  43.31 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  39.46 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  39.46 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  39.46 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  39.76 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2402  signal peptidase I  39.76 
 
 		 214 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000528092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  39.46 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  42.14 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  40.88 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  40.88 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0312  signal peptidase I  40.12 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.531917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  38.95 
 
 		 271 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  40.96 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  40.78 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  39.88 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  43.15 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  38.17 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  40.11 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  38.17 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  40.11 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  38.17 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  37.76 
 
 		 216 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2878  signal peptidase I  37.28 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000523532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  36.36 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  45.32 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  37.21 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  43.45 
 
 		 172 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  43.26 
 
 		 203 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  40.72 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  41.18 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  37.29 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  40.38 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  39.2 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  40.61 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  42.42 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  34.2 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  37.78 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  36.56 
 
 		 217 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  37.78 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  37.78 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  37.78 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  35.9 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  37.22 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  37.08 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  37.08 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  37.08 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  35.38 
 
 		 243 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  35.52 
 
 		 248 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  39.07 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  37.64 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  40.96 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2284  signal peptidase I  40.49 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000707328  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  40.44 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  40.91 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1804  signal peptidase I  41.86 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0785426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1523  signal peptidase I  40.56 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000512014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  37.77 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  39.02 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  37.13 
 
 		 261 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  37.5 
 
 		 352 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.58 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  34.45 
 
 		 469 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  33.18 
 
 		 313 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0427  Signal peptidase I  37.42 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  38.59 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  38.29 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1103  Signal peptidase I  33.33 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  33 
 
 		 236 aa  94.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  35.08 
 
 		 215 aa  94.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  38.85 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2877  signal peptidase I  36.59 
 
 		 198 aa  94.4  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  32.76 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  36.26 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  32.97 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>