More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_959 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  83.58 
 
 		 481 aa  837    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  90.19 
 
 		 479 aa  914    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  100 
 
 		 479 aa  998    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  34.32 
 
 		 240 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.26 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  33.19 
 
 		 251 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 277 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 		 221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.44 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.06 
 
 		 305 aa  130  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 		 204 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  36.04 
 
 		 302 aa  129  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 		 522 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 247 aa  127  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 275 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.36 
 
 		 256 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.52 
 
 		 275 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  35.1 
 
 		 244 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  32.3 
 
 		 264 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.68 
 
 		 368 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 		 261 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  35.07 
 
 		 229 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 1154 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 232 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 224 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 241 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 		 413 aa  117  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 213 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 213 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 213 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 236 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  36.42 
 
 		 317 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.21 
 
 		 241 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 213 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  32.65 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  36.54 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 241 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 		 220 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 291 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  31.78 
 
 		 270 aa  114  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 222 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.21 
 
 		 241 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  31.22 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 217 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.47 
 
 		 258 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.21 
 
 		 244 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 1099 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  31.63 
 
 		 272 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  34.34 
 
 		 246 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.43 
 
 		 1120 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 242 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  29.65 
 
 		 281 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 238 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 		 243 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  34.34 
 
 		 349 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 234 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  32.86 
 
 		 234 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  30.7 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31.22 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 		 280 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  32.84 
 
 		 256 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 229 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 264 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 235 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  35.47 
 
 		 284 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 752 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 234 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.59 
 
 		 1101 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  29.27 
 
 		 258 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 234 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 234 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.66 
 
 		 243 aa  106  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  34.36 
 
 		 300 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  35.96 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  36.65 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  32.64 
 
 		 235 aa  106  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 234 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>