71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_885 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  94.57 
 
 		 129 aa  246  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  95.35 
 
 		 129 aa  245  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  45.74 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  42.52 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.31 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  42.19 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  42.74 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.84 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.06 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  38.71 
 
 		 143 aa  105  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.84 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  44.19 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  38.28 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  41.41 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.51 
 
 		 141 aa  103  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  41.46 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.71 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.94 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  39.53 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  36.72 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.94 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  35.16 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  35.48 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.96 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.96 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  35.48 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  40.34 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.96 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  36.72 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  36.72 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.4 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  38.28 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  38.76 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  38.83 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.9 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  36.22 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.72 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  32.56 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  32.56 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.21 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.56 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  42.31 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.22 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  31.01 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.06 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.43 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  32.56 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  32.54 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  38.89 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  34.15 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  33.01 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  34.51 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  33.63 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  27.91 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  34 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.34 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  26.98 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.19 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  29.03 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2685  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.176029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  37.5 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.93 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>