More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_866 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  100 
 
 
177 aa  355  1e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  99.44 
 
 
177 aa  354  4e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  98.31 
 
 
177 aa  348  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  1.69889e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  63.95 
 
 
187 aa  238  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  61.63 
 
 
194 aa  231  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  61.05 
 
 
194 aa  229  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  63.69 
 
 
188 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  57.89 
 
 
201 aa  216  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  57.56 
 
 
175 aa  210  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.72103e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  52.02 
 
 
175 aa  205  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  6.2864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  52.27 
 
 
178 aa  203  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  53.76 
 
 
175 aa  203  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.47395e-09  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  53.98 
 
 
181 aa  198  4e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  56.07 
 
 
175 aa  195  2e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.00106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  52.02 
 
 
174 aa  194  5e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  7.27534e-14  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  53.98 
 
 
177 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  51.72 
 
 
180 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  53.45 
 
 
176 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.96245e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  53.37 
 
 
182 aa  187  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  53.37 
 
 
182 aa  187  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  54.07 
 
 
175 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.33733e-06  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  50.57 
 
 
177 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.80311e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  48.63 
 
 
306 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  52.81 
 
 
182 aa  184  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  48.37 
 
 
266 aa  184  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  51.72 
 
 
203 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  47.34 
 
 
267 aa  182  2e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  50 
 
 
179 aa  181  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 
175 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  4.51246e-06 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 
175 aa  180  9e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  49.72 
 
 
184 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.44 
 
 
185 aa  179  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  49.72 
 
 
183 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  50.88 
 
 
175 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  50.88 
 
 
175 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
176 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  50.29 
 
 
175 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  51.15 
 
 
175 aa  178  3e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 
185 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 
178 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  2.31337e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 
185 aa  178  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  8.22613e-07 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  44.16 
 
 
272 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.82 
 
 
173 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 
185 aa  177  5e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  50.88 
 
 
184 aa  177  5e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  46.15 
 
 
276 aa  177  5e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 
178 aa  177  5e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  1.9364e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
238 aa  177  6e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
270 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 
270 aa  177  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.649e-05  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 
185 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  46.28 
 
 
272 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  52.27 
 
 
177 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.31665e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  42.93 
 
 
271 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  47.19 
 
 
266 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  8.47824e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 
179 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  7.38018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  48.28 
 
 
177 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.29 
 
 
176 aa  174  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.61776e-05  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  49.14 
 
 
185 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  47.67 
 
 
176 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  47.98 
 
 
190 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.73158e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 
177 aa  174  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  43.72 
 
 
266 aa  174  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  47.43 
 
 
175 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  47.75 
 
 
185 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  50 
 
 
194 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  50 
 
 
177 aa  174  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  49.42 
 
 
198 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
179 aa  173  1e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  49.43 
 
 
179 aa  173  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  51.74 
 
 
203 aa  173  1e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  47.73 
 
 
193 aa  173  1e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  48.85 
 
 
177 aa  172  2e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  49.42 
 
 
199 aa  172  2e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  47.73 
 
 
193 aa  172  2e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  50 
 
 
190 aa  172  2e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  46.55 
 
 
180 aa  172  2e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.76433e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.57799e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  50.57 
 
 
190 aa  172  3e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  48.33 
 
 
180 aa  172  3e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.33893e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.63076e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.09294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  8.09778e-09  unclonable  4.06083e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 
177 aa  171  3e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.61698e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  50 
 
 
202 aa  172  3e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>