More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_838 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  96.67 
 
 		 210 aa  407  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  96.19 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  38.76 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  40.43 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  40.43 
 
 		 197 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  34.5 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  35.03 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  35.83 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  31.35 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  45.24 
 
 		 203 aa  98.2  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  43.9 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  42.97 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  41.79 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.31 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  41.01 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  39.29 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  40.67 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  32.67 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  37.61 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  36.47 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  29.65 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  36.92 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.22 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  33.5 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  33.52 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  38.85 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  47 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  38.46 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  32.97 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  39.38 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  39.75 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  35.71 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.24 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  37.68 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  45 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  43.75 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  39.13 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.13 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.16 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.91 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  43.31 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  36.19 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  40.46 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  29.28 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.85 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  35.82 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  34.97 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  29.74 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  33.9 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  31.82 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.19 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  33.18 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.76 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  34.19 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.56 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.71 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.76 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.76 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.76 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.76 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.76 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  38.52 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  33.71 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  39.68 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.92 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  32.67 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  28.5 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  28.72 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.97 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  33.54 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.97 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  33.01 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  35 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3740  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  31.71 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  32.93 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0982  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  27.95 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00892107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  43.64 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  35 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  27.31 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.16 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  35 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  33.74 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.5 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  29.47 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  36.23 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  42.45 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  32.64 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  34.46 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.44 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.1 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.25 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  31.1 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1504  hypothetical protein  29.9 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.04 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  33.16 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.15 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  29.38 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>