More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_807 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  91.85 
 
 		 506 aa  929    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  93.04 
 
 		 503 aa  939    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  100 
 
 		 503 aa  1027    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  52.57 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  51.59 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  49.01 
 
 		 517 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  49.3 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  49.6 
 
 		 512 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  48.33 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  48.47 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  49.11 
 
 		 787 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  49.12 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  47.06 
 
 		 494 aa  458  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  47.81 
 
 		 797 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  47.76 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  46.31 
 
 		 863 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  46.8 
 
 		 776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  46.22 
 
 		 772 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  45.76 
 
 		 532 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  45.36 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  45.17 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  46.06 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.77 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  45.83 
 
 		 863 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  47.52 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  44.97 
 
 		 506 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  47.54 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  46.08 
 
 		 518 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  45.31 
 
 		 777 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  43.25 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  45.13 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  43.58 
 
 		 539 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  45.25 
 
 		 491 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.89 
 
 		 864 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 		 852 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.72 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  46.41 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.4 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  42.21 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  43.37 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  44.06 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  42.69 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.62 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  45.12 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  45.12 
 
 		 487 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  44.8 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  42.69 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  43.57 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  45.98 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  45.45 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  42.47 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  44.14 
 
 		 496 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.38 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  46.09 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  45.38 
 
 		 495 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  41.72 
 
 		 490 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  43.29 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  42.12 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  41.52 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  42.89 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  42.89 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  43.65 
 
 		 858 aa  391  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.35 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  44.05 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  43.14 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  41.68 
 
 		 487 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  41.01 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  42.64 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  41.21 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  43.49 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  40.24 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  41.21 
 
 		 484 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  41 
 
 		 495 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  42.74 
 
 		 489 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  40.77 
 
 		 475 aa  381  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  40.81 
 
 		 575 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  40.94 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  42.54 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  42.43 
 
 		 483 aa  379  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  41.68 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  41.48 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  40.81 
 
 		 484 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  40 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  40.78 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  43.57 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.86 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  39.5 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.8 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  40.7 
 
 		 507 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  41.27 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  40.92 
 
 		 504 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  41.24 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  38.6 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  39.5 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>