More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_801 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, K subunit  100 
 
 
101 aa  196  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_801  NADH:quinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)  100 
 
 
101 aa  196  7e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0814  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  96.04 
 
 
101 aa  191  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1212  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.49 
 
 
106 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0142409  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3294  NADH dehydrogenase subunit K  57.58 
 
 
104 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  51.52 
 
 
103 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2039  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  50 
 
 
105 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0098763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5091  NADH dehydrogenase subunit K  52.63 
 
 
104 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3744  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.34 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3812  NADH dehydrogenase subunit K  50.52 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  50.51 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
107 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5469  NADH dehydrogenase subunit K  54.74 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5418  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4975  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5414  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5384  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.60096e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5536  NADH dehydrogenase subunit K  52.58 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0475445 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1293  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  43.56 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1013  NADH dehydrogenase subunit K  52.63 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5143  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4993  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  47.47 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5535  NADH dehydrogenase subunit K  53.68 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1042  NADH dehydrogenase subunit K  52.63 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  hitchhiker  0.00000310035 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01771  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0399  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  51.49 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  47 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.45 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2717  NADH dehydrogenase subunit K  50.5 
 
 
101 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  48.96 
 
 
107 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  45.45 
 
 
109 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0671  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 11 or 4L (chain K)-like protein  41.67 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  46.46 
 
 
109 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2526  NADH dehydrogenase subunit K  49.49 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1576  NADH dehydrogenase subunit K  48.51 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343884  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2095  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  52.04 
 
 
108 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0984  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  51.52 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2996  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  52.04 
 
 
108 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1290  F420H2 dehydrogenase subunit K  48.48 
 
 
100 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  7.20191e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1607  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.58 
 
 
105 aa  88.2  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.267693  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1057  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  45.74 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.722396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  39.58 
 
 
113 aa  87  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0477  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.86 
 
 
104 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.235495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.51 
 
 
100 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4072  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.4 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.035212  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3248  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.798847  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0549  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.924204  normal  0.59827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1565  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  46.46 
 
 
102 aa  84  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199091  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0711  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  45.83 
 
 
106 aa  84  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00926088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0971  NADH dehydrogenase subunit K  45.1 
 
 
101 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1110  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.24 
 
 
101 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1372  NADH dehydrogenase I chain K  40.4 
 
 
97 aa  83.6  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00536426  normal  0.982278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0695  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2526  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313411  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1188  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.288181  normal  0.242913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1924  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.21 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171281  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1994  NADH dehydrogenase subunit K  50 
 
 
101 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0298291  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.58 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40.82 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48.51 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1511  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.44 
 
 
101 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00505168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0148  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.84 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000206273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2548  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  43.01 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.252731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2049  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  42.57 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.879451  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1669  NADH dehydrogenase subunit K  50.57 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1306  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  40 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2204  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2555  NADH dehydrogenase subunit K  44.44 
 
 
101 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.485548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1881  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3128  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  48 
 
 
100 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2052  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0476  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.78 
 
 
102 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1159  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4987  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  51.02 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.666678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2234  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  48.51 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3406  NADH dehydrogenase subunit K  51.49 
 
 
101 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1540  NADH dehydrogenase subunit K  39.6 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0449834  normal  0.109303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1570  NADH dehydrogenase subunit K  39.6 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1594  NADH dehydrogenase subunit K  39.6 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1818  NADH dehydrogenase subunit K  38.38 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0556  NADH-quinone oxidoreductase chain K  41.41 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1607  NADH dehydrogenase (ubiquinone), K subunit  41.41 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1658  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  40.43 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.708964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03260  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2995  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  42.57 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1363  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
102 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4000  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46 
 
 
100 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.72795e-16 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0757  NADH dehydrogenase subunit K  47.52 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.588315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7681  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.6 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2928  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  44.55 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3916  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  46 
 
 
100 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1039  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  39.18 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1752  NADH dehydrogenase subunit K  43.56 
 
 
101 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0718  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  49.49 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1413  putative transmembrane NADH dehydrogenase I (chain K) oxidoreductase protein  42.42 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.272363  normal  0.0563536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7009  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  41.35 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1271  NADH dehydrogenase subunit K  46.53 
 
 
102 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0495478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>