30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_786 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_786  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  85.39 
 
 		 268 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0915  hypothetical protein  76.87 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  23.37 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  22.67 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  25.29 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  23.12 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  21.67 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  20 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  22.59 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  22.34 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  22.59 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  24.29 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  19.69 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  23.26 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  21.84 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  20.93 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  21.47 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  19.64 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  20.81 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  20.94 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  21.76 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  19.15 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  18.82 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  26.32 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  20.5 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  20 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  22.41 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  18.18 
 
 		 289 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  19.76 
 
 		 284 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>