144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_782 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  94.31 
 
 
369 aa  736    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  100 
 
 
369 aa  769    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  94.04 
 
 
389 aa  731    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  49.32 
 
 
367 aa  384  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  47.41 
 
 
367 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  49.32 
 
 
366 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  47.96 
 
 
366 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  44.54 
 
 
368 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  46.2 
 
 
388 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  44.38 
 
 
375 aa  318  7e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  44.11 
 
 
375 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  42.78 
 
 
357 aa  301  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  41.78 
 
 
357 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  39.51 
 
 
366 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  41.78 
 
 
368 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  40.81 
 
 
368 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  40.34 
 
 
352 aa  275  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  39.74 
 
 
367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  41.74 
 
 
370 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  39.25 
 
 
367 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  38.71 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  39.62 
 
 
366 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1544  peptidase M29 aminopeptidase II  36.93 
 
 
371 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  36.76 
 
 
371 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  37.1 
 
 
370 aa  229  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  36.31 
 
 
371 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  36.12 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  35.95 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  35.12 
 
 
359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  34.22 
 
 
367 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  34.93 
 
 
365 aa  215  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3002  peptidase M29 aminopeptidase II  34.15 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0261294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  35.14 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  35.14 
 
 
371 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  35.14 
 
 
371 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  35.14 
 
 
371 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  35.14 
 
 
371 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  35.14 
 
 
371 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  35.39 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  35.14 
 
 
371 aa  212  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4579  aminopeptidase  34.86 
 
 
371 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  34.86 
 
 
371 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4933  aminopeptidase  34.86 
 
 
371 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  34.59 
 
 
371 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  35.03 
 
 
374 aa  209  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  35.12 
 
 
363 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  33.51 
 
 
380 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  33.78 
 
 
360 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  34.21 
 
 
373 aa  206  5e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  34.05 
 
 
388 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  33.78 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  32.01 
 
 
406 aa  185  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  31.97 
 
 
410 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  32.09 
 
 
399 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3265  peptidase M29, aminopeptidase II  35.43 
 
 
304 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  32.66 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  29.49 
 
 
403 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  30.09 
 
 
399 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  29.79 
 
 
401 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3312  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like  32.49 
 
 
371 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.390308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  28.16 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  28.43 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  26.82 
 
 
417 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  26.2 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  26.29 
 
 
410 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  26.94 
 
 
409 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  27.12 
 
 
418 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  25.75 
 
 
418 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  27.02 
 
 
417 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2337  aminopeptidase  26.7 
 
 
409 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000192416  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  26.89 
 
 
416 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  26.18 
 
 
417 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  25.92 
 
 
423 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3777  peptidase M29, aminopeptidase II  26.33 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  25.77 
 
 
418 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  25.54 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  25.54 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  25.35 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  25.65 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  25.36 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3460  aminopeptidase 2  25.14 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.044996  hitchhiker  8.080459999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  25.65 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  25.65 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  25.65 
 
 
409 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  25.65 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1417  aminopeptidase family protein  24.88 
 
 
413 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  25.36 
 
 
409 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1887  aminopeptidase 2  25.35 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.302559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2148  aminopeptidase PepS  25.38 
 
 
417 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  25.36 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  25.36 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  24.78 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  24.78 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  25 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  25.91 
 
 
421 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  25.84 
 
 
411 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  25.98 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0523  PepS aminopeptidase  26.27 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00231455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  23.58 
 
 
418 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  25.42 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>