More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_691 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  95.61 
 
 		 205 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  88.02 
 
 		 217 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  43 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  42.58 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40.98 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  42.79 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  40.87 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  41.46 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  42.36 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  38.94 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  39.42 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  39 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  41.54 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  40.38 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  40.29 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.2 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  37.8 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 		 206 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 267 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  33.67 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.89 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  38.78 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  38.68 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1817  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000015217  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.87 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  37.31 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.71 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  35.35 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  32.31 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.01 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  34.01 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  39.9 
 
 		 204 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.5 
 
 		 212 aa  117  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.86 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  39.32 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  35.1 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.86 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  35.85 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  31.79 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  33.85 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  34.62 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  31.02 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  32.58 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.86 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  30.3 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  33.17 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  33.16 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  33.8 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.18 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  31.79 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>