More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_666 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  94.61 
 
 		 167 aa  322  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  94.01 
 
 		 167 aa  317  3e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  50.98 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  50.98 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  48.63 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  46.67 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  47.74 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  46 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  47.4 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  50 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  48.97 
 
 		 155 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  44.3 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  45.64 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  44.97 
 
 		 185 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  47.33 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  44.97 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  44.85 
 
 		 163 aa  133  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  46.67 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  47.33 
 
 		 170 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  46 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  46.62 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  43.62 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  50 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  43.45 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  43.33 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  44.3 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  44.87 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.95 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  45.33 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.29 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  45.45 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  45.39 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  47.59 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  44.9 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  44.3 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  41.14 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  42.07 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  50 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  44.52 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  43.14 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  42.21 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  43.23 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  42.48 
 
 		 171 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  44.44 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  44.23 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  42.18 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  44.9 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  44.67 
 
 		 177 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  42.18 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  44.67 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.22 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  42.07 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  45.27 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  42.18 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  44.67 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  44.67 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  44.67 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  43.54 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  41.94 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  42.11 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  43.24 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  41.72 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  42.86 
 
 		 169 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  39.86 
 
 		 171 aa  120  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  40.38 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  39.53 
 
 		 178 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  44.3 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  41.89 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  42.25 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  42.36 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  45.1 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.4 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2387  peptide deformylase  46.98 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  40.14 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  44.67 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  42.95 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  43.05 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  42.86 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  40.48 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  42 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  43.92 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.33 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  40.82 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2006  peptide deformylase  45.64 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0958745  hitchhiker  0.000967888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  40.82 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.33 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  41.92 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.83 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  40.82 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  40.82 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.25 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  44 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>