More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_659 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  95.19 
 
 		 582 aa  1143    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 643 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 645 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  100 
 
 		 582 aa  1211    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 644 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  95.7 
 
 		 582 aa  1146    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000323411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 643 aa  664    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 596 aa  644    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 636 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  52.41 
 
 		 644 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 644 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 644 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 636 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 638 aa  628  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 636 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 		 648 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 638 aa  621  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 		 636 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 644 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 		 644 aa  621  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  50.25 
 
 		 614 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 646 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 659 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 639 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 631 aa  611  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 635 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  51.89 
 
 		 684 aa  606  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 635 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 583 aa  606  9.999999999999999e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 649 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 633 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 581 aa  600  1e-170  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 634 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 		 635 aa  593  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 611 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 637 aa  594  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 604 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 		 684 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 647 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 637 aa  586  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 634 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 611 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 637 aa  582  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 639 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 635 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 652 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 638 aa  572  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 645 aa  572  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 605 aa  570  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000716431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 649 aa  569  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 645 aa  572  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 662 aa  565  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 646 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  52.43 
 
 		 564 aa  567  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 603 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 657 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 645 aa  560  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 657 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 659 aa  561  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 640 aa  560  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  46.4 
 
 		 676 aa  559  1e-158  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 640 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 643 aa  555  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 648 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 659 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 658 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 643 aa  551  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 637 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 602 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 647 aa  551  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 666 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  0.00000834751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 643 aa  551  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 636 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 682 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 645 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 595 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 602 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 645 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 595 aa  545  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 645 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 701 aa  547  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 634 aa  548  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 602 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 		 645 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 645 aa  544  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>