More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_643 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  90.24 
 
 		 380 aa  670    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  91.07 
 
 		 403 aa  723    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  100 
 
 		 403 aa  816    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  54.27 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  51.07 
 
 		 454 aa  356  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  54.02 
 
 		 441 aa  354  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  52.47 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  56.25 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  47.68 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  49.3 
 
 		 437 aa  316  4e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  48.23 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  54.86 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  45.8 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.7 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  52.85 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  42.86 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.73 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  45.09 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  49.84 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  50.63 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  44.71 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  49.05 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  49.05 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  53.02 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  43.9 
 
 		 435 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  50.51 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  48.73 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  55.1 
 
 		 451 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  47.65 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  47.65 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  48.5 
 
 		 420 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.52 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  46.61 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  46.63 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  51.32 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  51.83 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  50.61 
 
 		 582 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.81 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  42.34 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  47.15 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.81 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  46.35 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0590  GTP-binding proten HflX  47.03 
 
 		 396 aa  282  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.73 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3384  GTP-binding proten HflX  50.16 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.88 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.79 
 
 		 436 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.2 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.84 
 
 		 439 aa  279  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  47.04 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  47.47 
 
 		 435 aa  279  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  45.76 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  45.76 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  45.76 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  46.88 
 
 		 450 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  45.11 
 
 		 583 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  47.31 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  46.24 
 
 		 528 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  47.15 
 
 		 435 aa  276  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  46.52 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  46.52 
 
 		 454 aa  275  8e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  46.77 
 
 		 509 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  50.33 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  50.33 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  48.83 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  48.26 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  46.71 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  40.83 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  47.15 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.76 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  46.84 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  48.65 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  47.47 
 
 		 384 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.49 
 
 		 396 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  45.08 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  48.49 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  44.38 
 
 		 432 aa  272  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  48.49 
 
 		 395 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  45.09 
 
 		 421 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  42.26 
 
 		 435 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4169  GTP-binding proten HflX  47.78 
 
 		 432 aa  272  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00885496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  45.12 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  45.89 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  41.42 
 
 		 489 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  48.49 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  44.99 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.44 
 
 		 429 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  48.49 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  45.89 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  48.49 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  41.14 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  48.49 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  48.49 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  48.49 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  43.05 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  41.07 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  43.05 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  43.05 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2006  GTP-binding protein, HSR1-related  47.87 
 
 		 569 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>