More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_597 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  98.5 
 
 
200 aa  407  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  98.5 
 
 
200 aa  407  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  89.45 
 
 
200 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
208 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 
214 aa  147  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36 
 
 
213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.17 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 
211 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  34.02 
 
 
196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
459 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.35 
 
 
442 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.86 
 
 
442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
445 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.86 
 
 
442 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.86 
 
 
442 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
209 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.68 
 
 
207 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.31 
 
 
444 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 
448 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.82 
 
 
442 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
448 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 
224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
214 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.84 
 
 
442 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
449 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.84 
 
 
442 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
402 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 
443 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
447 aa  109  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
452 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
213 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
213 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
447 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
200 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 
256 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 
440 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  35.52 
 
 
197 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.8 
 
 
547 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  32.64 
 
 
200 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
214 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.25 
 
 
217 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
412 aa  104  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
235 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
240 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
208 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.51 
 
 
213 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
228 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
233 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
209 aa  102  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
205 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
411 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
201 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  30.46 
 
 
203 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
201 aa  102  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
215 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  101  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  101  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
229 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
212 aa  101  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
203 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
210 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 
210 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
203 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.98 
 
 
369 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
207 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
241 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
198 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
201 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
253 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
201 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
214 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
591 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  33.33 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.1 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.1 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.96 
 
 
203 aa  99  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
226 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
226 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.1 
 
 
203 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.1 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>