More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_590 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  97.09 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  94.16 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  94.16 
 
 		 274 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  43.36 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  43.65 
 
 		 409 aa  209  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 536 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 		 418 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  40.87 
 
 		 418 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  41.8 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.29 
 
 		 625 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  41.83 
 
 		 455 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  40.67 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  40.23 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  41.83 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 490 aa  198  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  42.19 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  44.76 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.92 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  39.37 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  40.25 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  43.91 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  38.74 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  38.19 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2702  ABC transporter related  38.85 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  38.74 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  42.21 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  38.04 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  39.13 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  37.25 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  37.94 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  38.34 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  42.06 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  40.93 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.32 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.02 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  35.98 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  38.34 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  39.92 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  41.07 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000943272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  37.89 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  39.68 
 
 		 253 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.03 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  40.85 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.94 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  35.97 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3343  ABC transporter for cobalamin/Fe3+-siderophores ATP-binding protein  41.2 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  35.46 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.08 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1712  ABC transporter related  38.28 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  39.29 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  39.66 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3058  ABC transporter related  41.5 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0667056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3140  ABC transporter related  39.13 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364263  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  35.94 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  39.68 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  39.52 
 
 		 405 aa  179  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  35.97 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  41.34 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.13 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  37.55 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  38.55 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.97 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.97 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.37 
 
 		 302 aa  178  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 273 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  35.97 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.65 
 
 		 424 aa  178  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3413  ABC Fe+3-siderophore transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  38.58 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.45 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1526  ABC transporter related  36.65 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  33.98 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  36.55 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>