More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_56 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  55.03 
 
 
829 aa  928  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  47.29 
 
 
872 aa  759  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0025  ATPase AAA-2 domain protein  48.37 
 
 
789 aa  785  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.93 
 
 
811 aa  954  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  45.27 
 
 
864 aa  724  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  45.37 
 
 
857 aa  720  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.97344e-05  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  56.48 
 
 
823 aa  895  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  50.75 
 
 
894 aa  795  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.81 
 
 
811 aa  952  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  45.35 
 
 
866 aa  723  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  44.97 
 
 
857 aa  729  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  44.57 
 
 
861 aa  724  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  45.25 
 
 
857 aa  731  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  45.25 
 
 
857 aa  731  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.79848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  48.7 
 
 
870 aa  756  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  51.02 
 
 
813 aa  810  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  45.25 
 
 
857 aa  731  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  58.21 
 
 
822 aa  943  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  50.85 
 
 
792 aa  800  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  58.74 
 
 
821 aa  963  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1508  ATP-dependent chaperone ClpB  44.98 
 
 
864 aa  728  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.280077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3951  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  44.19 
 
 
868 aa  734  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  58.04 
 
 
806 aa  928  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.09164e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  55.93 
 
 
810 aa  950  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0414  ATP-dependent chaperone ClpB  48.68 
 
 
870 aa  748  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  55.82 
 
 
830 aa  894  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  58.29 
 
 
825 aa  966  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  45.37 
 
 
872 aa  744  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  51.41 
 
 
826 aa  827  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  61.17 
 
 
834 aa  1009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  46.84 
 
 
861 aa  766  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  46.47 
 
 
864 aa  746  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.72053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  56.02 
 
 
826 aa  900  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.81 
 
 
811 aa  952  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.93 
 
 
811 aa  954  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2625  ATP-dependent chaperone ClpB  45.92 
 
 
874 aa  720  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0502533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  45.25 
 
 
857 aa  731  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  45.25 
 
 
857 aa  731  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  48.67 
 
 
846 aa  794  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6417  ATPase  48.12 
 
 
953 aa  736  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.243039 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7086  ATPase  48.4 
 
 
946 aa  742  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355216  normal  0.126483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  46.22 
 
 
874 aa  722  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  44.97 
 
 
857 aa  729  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  48.15 
 
 
791 aa  755  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  54.77 
 
 
820 aa  858  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  48.96 
 
 
792 aa  733  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  44.97 
 
 
857 aa  729  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  59.36 
 
 
812 aa  999  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  58 
 
 
816 aa  959  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  58.06 
 
 
811 aa  954  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  45.92 
 
 
874 aa  720  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  46.75 
 
 
859 aa  726  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5411  ATPase  48.43 
 
 
953 aa  754  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0379558 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  50.37 
 
 
830 aa  790  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  44.61 
 
 
861 aa  738  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  46.11 
 
 
872 aa  727  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  52.34 
 
 
840 aa  845  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5495  ATPase  48.75 
 
 
902 aa  747  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  49.51 
 
 
849 aa  804  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  45.8 
 
 
879 aa  724  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  48.9 
 
 
853 aa  796  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.16084e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  53.29 
 
 
869 aa  880  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1996  ATP-dependent chaperone ClpB  44.87 
 
 
866 aa  732  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  49.64 
 
 
849 aa  813  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  51.67 
 
 
814 aa  829  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  45.56 
 
 
874 aa  724  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  45.8 
 
 
874 aa  719  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  57.3 
 
 
814 aa  978  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6193  ATPase AAA-2 domain protein  48.83 
 
 
930 aa  733  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809707  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5492  ATPase AAA-2 domain protein  48.87 
 
 
944 aa  735  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.311641  normal  0.315903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  44.97 
 
 
857 aa  728  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  51.03 
 
 
860 aa  829  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  51.34 
 
 
839 aa  880  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6891  ATPase  47.92 
 
 
944 aa  733  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440431  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  49.57 
 
 
824 aa  830  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  57.55 
 
 
824 aa  962  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  52.83 
 
 
862 aa  869  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  58.34 
 
 
835 aa  941  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4026  ATPase AAA-2 domain protein  46.49 
 
 
868 aa  720  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  0.203961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  100 
 
 
824 aa  1662  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  50.86 
 
 
812 aa  828  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  57.46 
 
 
852 aa  919  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  50 
 
 
815 aa  793  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  66.42 
 
 
820 aa  1086  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  48.28 
 
 
867 aa  765  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  54.52 
 
 
819 aa  867  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  45.05 
 
 
871 aa  734  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  58.01 
 
 
858 aa  923  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  58.17 
 
 
837 aa  937  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  52.38 
 
 
850 aa  827  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  46.11 
 
 
857 aa  736  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  45.98 
 
 
876 aa  725  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  49.22 
 
 
843 aa  807  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0645  ATP-dependent chaperone ClpB  45.05 
 
 
892 aa  734  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  57.67 
 
 
868 aa  959  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  45.33 
 
 
872 aa  731  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  54.63 
 
 
815 aa  890  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11148  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  46.24 
 
 
848 aa  773  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  47.56 
 
 
855 aa  719  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  58.04 
 
 
836 aa  942  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>