More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_550 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  94.2 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  91.07 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  30.09 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.46 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  25.69 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  27.14 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  28.78 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3224  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  28.78 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.78 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.29 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.29 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  28.09 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  28.09 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.89 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  28.78 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  28.78 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  29.56 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  31.45 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  36.89 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  30 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  25.77 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.57 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  35 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  26.45 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 637 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  27.15 
 
 		 309 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  25.87 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.77 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.11 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.98 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  23.58 
 
 		 675 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.84 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.81 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 339 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53251  tRNA methyltransferase, has a role in tRNA modification  27.42 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.88 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  32.86 
 
 		 390 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  26.99 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  27.74 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>