90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_537 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  95.7 
 
 
442 aa  884    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  910    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  92.08 
 
 
442 aa  858    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  37.61 
 
 
433 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  39.55 
 
 
427 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  34.93 
 
 
458 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  32.73 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  36.01 
 
 
424 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  34.24 
 
 
447 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  34.92 
 
 
449 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  33.64 
 
 
436 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  35.6 
 
 
449 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  33.63 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  35.15 
 
 
449 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  32.27 
 
 
424 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  33.18 
 
 
450 aa  249  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  34.73 
 
 
445 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  32.05 
 
 
424 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  32.21 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  33.41 
 
 
448 aa  242  9e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  34.81 
 
 
450 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  31.6 
 
 
424 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  31.57 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  32.95 
 
 
430 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  33.11 
 
 
412 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  31.67 
 
 
424 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  30.73 
 
 
422 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  31.67 
 
 
454 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  28.9 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  26.52 
 
 
406 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  26.47 
 
 
413 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  28 
 
 
415 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  29.55 
 
 
413 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  27.35 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  27.88 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  29.11 
 
 
425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  27.13 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  27.93 
 
 
426 aa  146  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  27.51 
 
 
443 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  26.68 
 
 
415 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  27.42 
 
 
443 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  27.81 
 
 
437 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  26.5 
 
 
415 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  28.12 
 
 
418 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  26.46 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  26.46 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  27.63 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  24.6 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  26.46 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  25.95 
 
 
415 aa  140  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  25.78 
 
 
415 aa  139  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  27.44 
 
 
418 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  26.23 
 
 
415 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  26.74 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  24.94 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  24.04 
 
 
413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  26.85 
 
 
415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  28.75 
 
 
417 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  26.35 
 
 
411 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  24.38 
 
 
413 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  27.07 
 
 
404 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  27.64 
 
 
404 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  27.91 
 
 
418 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  26.14 
 
 
413 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  24.49 
 
 
410 aa  127  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  26 
 
 
413 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  26.51 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  26.33 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  26.65 
 
 
404 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  26.89 
 
 
404 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  24.82 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  26.89 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  25.61 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  25.56 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  26.89 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  26.22 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  27.05 
 
 
406 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  25.78 
 
 
407 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  24.61 
 
 
412 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  27.18 
 
 
277 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  23.78 
 
 
411 aa  96.7  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  25.22 
 
 
414 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  23.29 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  21.81 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5444  hypothetical protein  24.13 
 
 
395 aa  56.6  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3515  hypothetical protein  22.61 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  23.89 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2730  hypothetical protein  25.68 
 
 
394 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00608426  hitchhiker  0.000203528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  22.52 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.282654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>