More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_522 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0583  recombination protein RecR  97.06 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  95.59 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  54.92 
 
 		 199 aa  239  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  52.31 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  54.92 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  53.65 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  57.29 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  51.28 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  54.36 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000136854  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  54.64 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  55.15 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0254  recombination protein RecR  53.37 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136191  hitchhiker  0.0016505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  53.65 
 
 		 198 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  55.73 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  54.17 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  53.89 
 
 		 201 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  53.12 
 
 		 198 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0215  recombination protein RecR  53.89 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  54.64 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  55.21 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  53.12 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0268  recombination protein RecR  55.21 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  53.65 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  52.58 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  52.33 
 
 		 199 aa  224  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0479  recombination protein RecR  53.09 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0004265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  52.85 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  52.85 
 
 		 199 aa  222  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  53.65 
 
 		 199 aa  222  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  52.58 
 
 		 199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6566  recombination protein RecR  54.69 
 
 		 199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00960042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  52.36 
 
 		 200 aa  220  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  51.56 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  52.58 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  50.25 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  52.11 
 
 		 198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  49.49 
 
 		 198 aa  218  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  52.08 
 
 		 198 aa  218  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  49.22 
 
 		 200 aa  217  7.999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  53.65 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  51.03 
 
 		 199 aa  216  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  53.12 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0048  recombination protein RecR  53.97 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  51.3 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  52.36 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  49.76 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  51.83 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  50.79 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  52.08 
 
 		 199 aa  214  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  51.58 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  50.26 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  50 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  50 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  48.95 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  49.48 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4329  recombination protein RecR  50.78 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.63547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  52.38 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  51.03 
 
 		 198 aa  208  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0096  recombination protein RecR  47.15 
 
 		 197 aa  207  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1180  recombination protein RecR  49.49 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000222469  normal  0.0115718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0673  recombination protein RecR  52.06 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28430  DNA replication and repair protein RecR  50.78 
 
 		 197 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1533  recombination protein RecR  50.52 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  51.6 
 
 		 222 aa  204  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0883  recombination protein RecR  48.48 
 
 		 204 aa  204  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254341  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  48.99 
 
 		 204 aa  204  7e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  48.21 
 
 		 197 aa  204  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  48.99 
 
 		 204 aa  204  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  48.74 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36550  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1172  recombination protein RecR  47.74 
 
 		 205 aa  201  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000693632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  46.88 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  48.7 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  46.43 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  47.21 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  49.74 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0299  recombination protein RecR  46.11 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.26896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  44.56 
 
 		 199 aa  197  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  47.92 
 
 		 198 aa  197  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13747  recombination protein RecR  47.72 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.24685  normal  0.507184 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1639  DNA replication and repair protein RecR  45.96 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5291  recombination protein RecR  46.41 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>