More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_503 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03616  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  99.57 
 
 		 464 aa  939    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 460 aa  640    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 		 465 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 460 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.28 
 
 		 464 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  63.94 
 
 		 487 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4262  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.227124  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5168  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05631 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4247  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000144412  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4255  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 460 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 460 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 460 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 468 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 468 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3948  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 460 aa  638    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4194  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 460 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.63 
 
 		 462 aa  678    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4547  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 		 460 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  68.4 
 
 		 471 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.42 
 
 		 475 aa  635    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 460 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  98.28 
 
 		 464 aa  927    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 464 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.61 
 
 		 467 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 464 aa  944    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 460 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 460 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3993  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 460 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  66.81 
 
 		 460 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 460 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4257  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.03 
 
 		 460 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 460 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4090  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 460 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 459 aa  632  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.25 
 
 		 458 aa  631  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.65 
 
 		 472 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 471 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 473 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.16 
 
 		 459 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.16 
 
 		 470 aa  628  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.24 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.45 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 		 462 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 		 462 aa  628  1e-179  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.67 
 
 		 473 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 458 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.02 
 
 		 464 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.91 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3203  ATP synthase F1, beta subunit  66.09 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 		 462 aa  624  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 		 462 aa  625  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2807  ATP synthase F1, beta subunit  66.09 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.339111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  65.08 
 
 		 458 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.14 
 
 		 458 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.86 
 
 		 457 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  65.01 
 
 		 467 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.37 
 
 		 464 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.42 
 
 		 482 aa  623  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.52 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 458 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 458 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.02 
 
 		 463 aa  621  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.87 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.85 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 		 465 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0097  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.15 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.26731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0420  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 469 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  65 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 469 aa  617  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 469 aa  617  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 469 aa  617  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.12 
 
 		 467 aa  620  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  64.94 
 
 		 465 aa  619  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.39 
 
 		 469 aa  617  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  64.4 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0122  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.08 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2949  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.08 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.16 
 
 		 465 aa  621  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.17 
 
 		 472 aa  621  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.08 
 
 		 464 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.08 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.29 
 
 		 461 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.29 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.29 
 
 		 458 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.15 
 
 		 475 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.18 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4042  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.64 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1587  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.86 
 
 		 459 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.986893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>