More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_502 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_502  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00717942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0537  ATP synthase F1, gamma subunit  95.09 
 
 		 285 aa  556  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.468806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0563  ATP synthase F1, gamma subunit  96.49 
 
 		 285 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.071167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50.35 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.83 
 
 		 290 aa  275  8e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.48 
 
 		 290 aa  271  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  49.27 
 
 		 291 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.76 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.42 
 
 		 281 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3318  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.26 
 
 		 291 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629678  normal  0.0205724 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.39 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 		 291 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3188  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.58 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.49841  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.58 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.48 
 
 		 288 aa  251  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.45 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.101657  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.45 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0254  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.1 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0302  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.73388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.05 
 
 		 288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0371  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.73 
 
 		 288 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.02 
 
 		 289 aa  245  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0326  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.612549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0021  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.9 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  hitchhiker  0.00122657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2745  ATP synthase F1, gamma subunit  44.07 
 
 		 291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0214  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.86 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.42 
 
 		 290 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.39 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.93 
 
 		 293 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.26 
 
 		 283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1697  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.3 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.23 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0282058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.91 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.21 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.1 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.6 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3028  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.95 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.75 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.76 
 
 		 291 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2147  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.73 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0177  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.73 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3895  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.09 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0039  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.09 
 
 		 294 aa  235  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0292882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2588  ATP synthase F1, gamma subunit  42.71 
 
 		 286 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.386867  normal  0.0481997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.75 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3287  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.44 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 286 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0479  ATP synthase F1, gamma subunit  44.6 
 
 		 291 aa  231  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.4 
 
 		 286 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.4 
 
 		 286 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.47 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4871  ATP synthase F1, gamma subunit  44.95 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  42.81 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2798  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.39 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0096  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0011  ATP synthase F1, gamma subunit  43.79 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2956  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3356  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3014  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0180  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3969  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2950  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0738398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0121  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1588  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.73 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506697  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4043  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.41 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.41 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.4 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.49 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.98 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2166  ATP synthase F1, gamma subunit  44.17 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.95002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.95 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00792129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.15 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3645  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.06 
 
 		 286 aa  228  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0627563  unclonable  0.00000957425 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.56 
 
 		 287 aa  228  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.21 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3527  ATP synthase F1, gamma subunit  42.95 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0286312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.66 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>