More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_5 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4526  GTP diphosphokinase  45.78 
 
 
727 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0005  GTP pyrophosphokinase  97.12 
 
 
728 aa  1455    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_5  relA/spoT protein, GTP pyrophosphokinase  100 
 
 
728 aa  1510    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3123  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.75 
 
 
727 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00942759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4491  GTP pyrophosphokinase  46.06 
 
 
727 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0733  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.03 
 
 
721 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1344  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.83 
 
 
724 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000566061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2510  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.64 
 
 
732 aa  689    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00123268  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4302  GTP pyrophosphokinase  45.77 
 
 
727 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4140  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  45.77 
 
 
727 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4151  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  45.89 
 
 
727 aa  685    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3609  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.16 
 
 
726 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00130344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.35 
 
 
856 aa  637    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.710721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4475  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.21 
 
 
751 aa  695    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0971  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.29 
 
 
727 aa  658    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000148672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4637  GTP pyrophosphokinase  45.77 
 
 
727 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4487  GTP diphosphokinase  45.77 
 
 
727 aa  682    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000280159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  47.35 
 
 
717 aa  687    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0939  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.59 
 
 
732 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12190  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.72 
 
 
716 aa  686    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000855141  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  49.44 
 
 
721 aa  740    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1219  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.48 
 
 
771 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.46 
 
 
726 aa  699    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000567155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0379  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.01 
 
 
710 aa  681    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2287  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.83 
 
 
727 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421652  hitchhiker  0.000000120051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0901  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.26 
 
 
712 aa  661    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0988529  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0005  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  96.15 
 
 
728 aa  1426    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4254  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.9 
 
 
727 aa  682    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00950275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2193  GTP pyrophosphokinase  43.8 
 
 
726 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1904  GTP pyrophosphokinase  43.11 
 
 
726 aa  646    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0709  GTP diphosphokinase  45.78 
 
 
727 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.348241  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0806  GTP diphosphokinase  43.98 
 
 
734 aa  646    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000171798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4122  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  48.46 
 
 
774 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1951  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.1 
 
 
726 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2720  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.41 
 
 
802 aa  640    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865135  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  46.65 
 
 
725 aa  687    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1288  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.14 
 
 
729 aa  661    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0314087  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4541  GTP diphosphokinase  45.77 
 
 
727 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21900  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  43.62 
 
 
789 aa  634  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4989  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.55 
 
 
751 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.24 
 
 
742 aa  631  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1097  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.8 
 
 
735 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00537939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1735  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.66 
 
 
747 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3160  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.43 
 
 
716 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000534468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2325  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  42.43 
 
 
716 aa  626  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000013827  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0431  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.33 
 
 
715 aa  627  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4829  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.7 
 
 
749 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1433  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.96 
 
 
743 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2236  GTP pyrophosphokinase  42.56 
 
 
716 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1459  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.96 
 
 
743 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0885  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.9 
 
 
733 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2399  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.55 
 
 
717 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.088294  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.28 
 
 
746 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1724  GTP pyrophosphokinase  41.47 
 
 
729 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2572  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.23 
 
 
748 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1052  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.47 
 
 
716 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.28 
 
 
746 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  44.96 
 
 
750 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3211  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.47 
 
 
716 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00108978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1691  GTP pyrophosphokinase  41.47 
 
 
729 aa  616  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.599497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.17 
 
 
746 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3695  RelA/SpoT protein  45.3 
 
 
747 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.120676  hitchhiker  0.00160014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4217  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  44.41 
 
 
747 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.630753  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3187  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.54 
 
 
714 aa  612  9.999999999999999e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190275  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2284  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.23 
 
 
716 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0529541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.14 
 
 
746 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1694  GTP pyrophosphokinase  45.15 
 
 
744 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1213  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.92 
 
 
756 aa  611  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.167676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1377  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
779 aa  612  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.790837  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0548  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.19 
 
 
813 aa  609  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4576  GTP pyrophosphokinase  45.03 
 
 
747 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2530  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  45.12 
 
 
789 aa  609  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471952  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1945  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.43 
 
 
779 aa  612  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.712963  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  45.41 
 
 
749 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3042  (p)ppGpp synthetase I  42.95 
 
 
758 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3812  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.29 
 
 
790 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225283  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52180  GTP pyrophosphokinase  45.03 
 
 
747 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00224344  normal  0.0200902 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0857  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  41.42 
 
 
750 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1740  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 
736 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15130  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  42.98 
 
 
812 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0120895  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2505  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  43.24 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2653  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.02 
 
 
750 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1363  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.54 
 
 
804 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.401853  normal  0.596174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2319  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.04 
 
 
806 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.528198  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  42.64 
 
 
814 aa  601  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2058  (p)ppGpp synthetase I  42.64 
 
 
786 aa  601  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226647  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2280  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.04 
 
 
801 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.753689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2327  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.04 
 
 
801 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0335883  normal  0.296201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.94 
 
 
788 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2238  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  44.74 
 
 
745 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1196  GTP pyrophosphokinase  41.34 
 
 
729 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0487271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0721  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  40.88 
 
 
745 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000459955  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2550  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  41.8 
 
 
746 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2359  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.95 
 
 
793 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0947  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  43.91 
 
 
721 aa  592  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.452547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1299  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.67 
 
 
746 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12603  GTP pyrophosphokinase relA  42.27 
 
 
790 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000342988  normal  0.752099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1400  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.67 
 
 
746 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1311  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  41.45 
 
 
738 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1698  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  42.78 
 
 
766 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>