59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_488 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  93.99 
 
 		 183 aa  343  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  87.98 
 
 		 183 aa  330  8e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  51.37 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  50.82 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  50.82 
 
 		 183 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  50.27 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  51.91 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  46.99 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  51.38 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  47.65 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  46.99 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  40.76 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  38.59 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 		 185 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  38.59 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  40.98 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  35.14 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  38.73 
 
 		 191 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  38.55 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  39.25 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  36.08 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  40.99 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  38.15 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  36.99 
 
 		 214 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  38.69 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  36.42 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  37.3 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  33.15 
 
 		 183 aa  94.4  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  32.72 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  29.7 
 
 		 213 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  31.61 
 
 		 224 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  37.2 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  36.2 
 
 		 771 aa  82  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  28.71 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  36.46 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  36.42 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  36.08 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>