25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_480 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_480  primosome component  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0539  DnaD and phage-associated domain-containing protein  91.1 
 
 		 236 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0515  primosome, DnaD subunit  84.75 
 
 		 236 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1148  primosome, DnaD subunit  35.11 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000149796  decreased coverage  0.00111014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0088  primosome, DnaD subunit  37.95 
 
 		 241 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3989  primosome, DnaD subunit  35.11 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2341  primosome, DnaD subunit  34.68 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00367055  decreased coverage  0.00187348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  28.4 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3294  DnaD domain-containing protein  37.04 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3032  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2981  hypothetical protein  35.14 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3267  DnaD domain protein  37.33 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3331  DnaD domain-containing protein  36.36 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3088  DnaD domain-containing protein  36.36 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3310  DnaD domain protein  40 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3302  DnaD domain protein  36.71 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2999  primosome, DnaD subunit  41.67 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000267643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  39.34 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1980  phage protein  39.06 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0561  DnaA analog, DnaD domain protein  33.87 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0622726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  36.51 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0636  DnaA analog, DnaD domain protein  33.87 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3612  primosome, DnaD subunit  33.87 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1357  DnaD domain protein  32.84 
 
 		 316 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4408  DnaD domain protein  32.26 
 
 		 313 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>