More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_479 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  94.6 
 
 		 426 aa  846    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  90.64 
 
 		 469 aa  894    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  100 
 
 		 470 aa  983    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  36.52 
 
 		 263 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  46.71 
 
 		 241 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  39.15 
 
 		 263 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 266 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  38.86 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  43.26 
 
 		 236 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  35.26 
 
 		 263 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 267 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  34.68 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  34.68 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  34.68 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  34.68 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  38.46 
 
 		 247 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  37.5 
 
 		 241 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  34.25 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  38.79 
 
 		 275 aa  94  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  36.09 
 
 		 241 aa  90.5  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  28.39 
 
 		 261 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  33.72 
 
 		 283 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  28.57 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  39.84 
 
 		 242 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  31.76 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  27.23 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  36.84 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  30.87 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  29.89 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  33.33 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  27.65 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  27.44 
 
 		 245 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  32.62 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  28.89 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  28.57 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  29.93 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 257 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  31.97 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  30.11 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  33.01 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1848  IstB domain protein ATP-binding protein  33.59 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  27.08 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  25.59 
 
 		 293 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0134  IstB domain protein ATP-binding protein  31.21 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 251 aa  63.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  24.63 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  32.14 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  26.42 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  25.76 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  32.14 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  30.71 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  29.55 
 
 		 211 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  24.22 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  30.53 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  27.84 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  25.95 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  27.03 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  26.83 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  26.83 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  31.53 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  35.77 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  35.77 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  26.5 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  30 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1531  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 246 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  31.48 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>