76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_466 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  97.1 
 
 		 276 aa  519  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  95.65 
 
 		 276 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  38.46 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  37.87 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  33.7 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  32.22 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  33.04 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  30.49 
 
 		 251 aa  92.8  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  28.45 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  28.38 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  31.58 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  26.29 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  30.31 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  27.55 
 
 		 297 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  26.11 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  25.75 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  25.75 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  29.39 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  27.35 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  26.69 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  24.71 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  24.58 
 
 		 226 aa  72  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  29.58 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  26.36 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.51 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  25.74 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  26.96 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  27.23 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  23.08 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  22.92 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  25.96 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  25.53 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  26.99 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  24.08 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  26.27 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  22.35 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  27.54 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  23.01 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  24.43 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  22.36 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  22.36 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  21.85 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  22.31 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  20 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  21.85 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  22.27 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  21.59 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  20.38 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  25.11 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  22.5 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  25.64 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  22.63 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  21.68 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  24.15 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  24.89 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  23.17 
 
 		 285 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  21.15 
 
 		 236 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  25.11 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  21.29 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  26.57 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  23.58 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  23.53 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  23.91 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  22.1 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  21.83 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  21.07 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  20.4 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  21.23 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  21.43 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  22.86 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  25.11 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  23.3 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  22.32 
 
 		 296 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>