More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_451 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  88.51 
 
 		 475 aa  746    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  100 
 
 		 409 aa  837    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  92.42 
 
 		 414 aa  778    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  50.74 
 
 		 474 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  48.77 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  39.36 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.63 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  39.85 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  38.39 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.35 
 
 		 469 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  39.08 
 
 		 488 aa  298  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.96 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.41 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  40.15 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  37.22 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  36.59 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  37.04 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  35.94 
 
 		 470 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  34.72 
 
 		 467 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  36.61 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.36 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.12 
 
 		 474 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  33.99 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.19 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.85 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  33.17 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.12 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.78 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  35.48 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.15 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  34.73 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  33.83 
 
 		 473 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  34.23 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  34.75 
 
 		 475 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35 
 
 		 475 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.25 
 
 		 463 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  34.62 
 
 		 490 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.57 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.57 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  35.57 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  34.44 
 
 		 474 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.94 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.4 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  34.24 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  33.91 
 
 		 460 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  32.76 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  34.4 
 
 		 460 aa  225  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.75 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.9 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  33.08 
 
 		 484 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  32.42 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.29 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  32.92 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  32.84 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  32.45 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  32.03 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  32.03 
 
 		 486 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  32.67 
 
 		 473 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.66 
 
 		 464 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  36.41 
 
 		 477 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.98 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  34.08 
 
 		 733 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  34.07 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33 
 
 		 487 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.06 
 
 		 487 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  31.49 
 
 		 484 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  31.55 
 
 		 485 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  30.58 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.41 
 
 		 484 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.29 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  32.2 
 
 		 486 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  34.4 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  34.44 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  30.73 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  30.1 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.51 
 
 		 473 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  29.48 
 
 		 501 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  33.9 
 
 		 487 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  29.34 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  34.43 
 
 		 452 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  29.65 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  31.55 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  33.16 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  32.16 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.83 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.69 
 
 		 574 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  32.38 
 
 		 450 aa  149  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.77 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  28.75 
 
 		 458 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.84 
 
 		 518 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1857  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.54 
 
 		 559 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.86 
 
 		 576 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2334  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  30.05 
 
 		 577 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  27.63 
 
 		 549 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  29.82 
 
 		 478 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  28.1 
 
 		 551 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  29.23 
 
 		 449 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23220  phosphomannomutase  27.02 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0833  phosphoglucomutase  27.63 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>