More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_438 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  97.6 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  93.63 
 
 		 251 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  57.55 
 
 		 248 aa  291  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  54.66 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  55.1 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  54.44 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  53.57 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  55.47 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  55.79 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 		 250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  56.73 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  54.69 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  53.44 
 
 		 248 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  56.4 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  53.04 
 
 		 248 aa  278  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  52.61 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  55.69 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  54.69 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  57.83 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  52.36 
 
 		 256 aa  275  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  54.69 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  52.8 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  53.63 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 		 249 aa  272  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  52 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  52.97 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  52.97 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  52.97 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  48.37 
 
 		 266 aa  268  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  54.24 
 
 		 236 aa  268  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 247 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  52.44 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  51.84 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 		 272 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  52.23 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  51.79 
 
 		 281 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  52.21 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  47.24 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  52.38 
 
 		 259 aa  258  7e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  54.24 
 
 		 236 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  52.65 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  51.21 
 
 		 250 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  53.81 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 		 254 aa  254  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 		 273 aa  254  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  51.95 
 
 		 259 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  45.97 
 
 		 272 aa  251  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  47.66 
 
 		 257 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  47.35 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  51.38 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  48.18 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  48.16 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  47.35 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  51 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12113  methionine aminopeptidase, type I  47.79 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0855577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  51.38 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  51.28 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  45.34 
 
 		 276 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  47.77 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  48.44 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  46.59 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  48.16 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  46.37 
 
 		 252 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  48.77 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  47.77 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  47.77 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  44.94 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  47.77 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  45.38 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  45.12 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0935  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 		 265 aa  241  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.976689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0105  methionine aminopeptidase, type I  47.13 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 		 281 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 		 271 aa  241  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>