More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_347 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  89 
 
 		 291 aa  533  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  87.63 
 
 		 291 aa  524  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  44.77 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2292  dimethyladenosine transferase  44.89 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.777325  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0285  dimethyladenosine transferase  44.09 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2111  dimethyladenosine transferase  45.08 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  43.23 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0077  dimethyladenosine transferase  40.5 
 
 		 293 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000377526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0111  dimethyladenosine transferase  39.26 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.294487  hitchhiker  0.00410281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  41.33 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4092  dimethyladenosine transferase  42.18 
 
 		 288 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  43.24 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000822785 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  38.63 
 
 		 295 aa  195  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  39.39 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  39.21 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  40.81 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  40.07 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  36.16 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000452453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  41.11 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  38.04 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  38.27 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  38.69 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  37.09 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0074  dimethyladenosine transferase  44.09 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000211917  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  37.77 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  37.77 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  40.08 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000265248  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0392  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00405196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1304  dimethyladenosine transferase  38.81 
 
 		 275 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000005204  normal  0.0246501 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  38.01 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  37 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  36.63 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  38.87 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  39.37 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  39.47 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  36.92 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  37.27 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  37.35 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  36.8 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3485  dimethyladenosine transferase  37.26 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0046  dimethyladenosine transferase  30.99 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  36.47 
 
 		 277 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4416  dimethyladenosine transferase  36.26 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04920  dimethyladenosine transferase  36.5 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.775461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  35.85 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000057406  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4480  dimethyladenosine transferase  35.88 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 273 aa  153  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1848  dimethyladenosine transferase  38.46 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  36.74 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1935  dimethyladenosine transferase  37.22 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  35.63 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  36.76 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2288  dimethyladenosine transferase  36.67 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04645  dimethyladenosine transferase  34.85 
 
 		 262 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0575079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1636  dimethyladenosine transferase  34.05 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199976  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  38.6 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  32.96 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  35.42 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  35.98 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  35.16 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  36.84 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2658  ribosomal RNA adenine methylase transferase  32.24 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  34.63 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  34.63 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  36.36 
 
 		 266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  33.7 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  35.61 
 
 		 267 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  35.04 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000357619  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1023  dimethyladenosine transferase  35.94 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.867687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  32.21 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03390  dimethyladenosine transferase  35.82 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4800  dimethyladenosine transferase  34.19 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2614  dimethyladenosine transferase  36.16 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  37.01 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  35.85 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  34.29 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000398679  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  33.58 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  35.11 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  39.17 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>