More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_345 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  98.99 
 
 
200 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  96.5 
 
 
200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.56 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.9 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.5 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  27.14 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.09 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.04 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.52 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.6 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  26.07 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  27.39 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4204  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.6 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  25 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.68 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.49 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.53 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  29.09 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.07 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  32.45 
 
 
357 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0225  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000005452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.15 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.4 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  31.79 
 
 
352 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0403  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  28.88 
 
 
341 aa  65.1  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.33 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0374  demethylmenaquinone methyltransferase  27.4 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  27.14 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.68 
 
 
258 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.33 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  28.97 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.33 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  28.85 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.15 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.06 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2941  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.73 
 
 
261 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.33 
 
 
256 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.95 
 
 
235 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.19 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.17 
 
 
229 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.25 
 
 
257 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  28.3 
 
 
250 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2621  methyltransferase  32.2 
 
 
261 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.548426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2644  methyltransferase  31.36 
 
 
261 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0423484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 
337 aa  61.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  33.83 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2695  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.36 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0592543  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.72 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.76 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2890  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.36 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  29.33 
 
 
351 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2893  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.36 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  26.03 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  26.46 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.14 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.39 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 
252 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.33 
 
 
287 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  27.52 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.7 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  29.33 
 
 
351 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.28 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  26.19 
 
 
353 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
506 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.79 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.36 
 
 
246 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
267 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.21 
 
 
256 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  29.33 
 
 
351 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  26.19 
 
 
353 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.82 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.21 
 
 
256 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
260 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.74 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.45 
 
 
261 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.39 
 
 
256 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.88 
 
 
269 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.71 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
275 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.39 
 
 
256 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.86 
 
 
235 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  26.86 
 
 
341 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>