More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_340 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_340  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 336 aa  692    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000967577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  90.18 
 
 		 336 aa  625  1e-178  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0397  thiamine-monophosphate kinase  86.9 
 
 		 336 aa  607  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  37.28 
 
 		 337 aa  195  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  38.21 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  38.26 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  37.68 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  39.37 
 
 		 323 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  37.1 
 
 		 334 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  35.07 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  35.57 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.33 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  38.19 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  35.38 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  35.29 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.47 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  35.53 
 
 		 340 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  33.53 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  35.24 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  35.26 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  32.19 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.87 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  35.14 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.35 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  33.91 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  34.64 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.71 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.24 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  35.06 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  33.63 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  35.58 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  33.52 
 
 		 363 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  33.24 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  33.73 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  34.06 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  35.91 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  33.71 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  33.85 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  34.63 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  33.81 
 
 		 346 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  35.31 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  34.31 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  32.65 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  34.08 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  34.68 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  34.17 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  34.77 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  33.61 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  32.69 
 
 		 346 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  32.46 
 
 		 332 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  35.56 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  35.14 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  31.66 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  32.04 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  33.23 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  32.94 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  32.25 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  37.4 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  35.56 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  34.09 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  31.8 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 319 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  33.97 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  35.22 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.18 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  33.23 
 
 		 330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.18 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  34.29 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0493  thiamine monophosphate kinase  31.88 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  35.46 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.86 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  30.09 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  35.6 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  34.26 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  33.04 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  35.6 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.35 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4465  thiamine-monophosphate kinase  34.86 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  35.13 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  33.63 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  32.4 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2116  thiamine-monophosphate kinase  34.98 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  31.1 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  35.03 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>