15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_291 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0352  hypothetical protein  93.07 
 
 		 476 aa  771    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000516311  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0330  hypothetical protein  80.56 
 
 		 573 aa  824    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000466055  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_291  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1137    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000223386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0600  hypothetical protein  30 
 
 		 421 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_568  hypothetical protein  29.74 
 
 		 421 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0627  hypothetical protein  28.45 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0351  hypothetical protein  96.05 
 
 		 76 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000017069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1525  hypothetical protein  26.02 
 
 		 2235 aa  54.7  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0432  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1002 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.259517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1240  hypothetical protein  23.12 
 
 		 481 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  24.83 
 
 		 1301 aa  50.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0621  fibronectin, type III domain-containing protein  31.75 
 
 		 318 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0839934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  41.43 
 
 		 2178 aa  44.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  37.08 
 
 		 442 aa  44.3  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1328  hypothetical protein  31.25 
 
 		 486 aa  43.5  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000298022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>