27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_188 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_188  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000488554  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0200  hypothetical protein  79.47 
 
 
303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000745264  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0153  hypothetical protein  70.2 
 
 
303 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00374289  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0392  Protein of unknown function DUF1616  34.04 
 
 
322 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00405742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1020  hypothetical protein  30.22 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.277922  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1376  hypothetical protein  29.89 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2405  hypothetical protein  31.41 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0165384  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2008  hypothetical protein  30.35 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1133  hypothetical protein  33.94 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0409  hypothetical protein  31.35 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.983566  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1143  hypothetical protein  34.54 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0715  hypothetical protein  25.27 
 
 
774 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1145  hypothetical protein  31.67 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1060  Protein of unknown function DUF1616  25.57 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0195  hypothetical protein  29 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000840433  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5177  Protein of unknown function DUF1616  31.69 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.228817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0822  Protein of unknown function DUF1616  35.87 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0878488  normal  0.67505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0062  Protein of unknown function DUF1616  27.61 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.248421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1137  Protein of unknown function DUF1616  23.71 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3282  Protein of unknown function DUF1616  26.07 
 
 
327 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2019  Protein of unknown function DUF1616  29.11 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00462585  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3441  Protein of unknown function DUF1616  28.98 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1466  membrane protein-like protein  40.58 
 
 
186 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.018549 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3009  Protein of unknown function DUF1616  26.73 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.661686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1212  Protein of unknown function DUF1616  24.89 
 
 
359 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0338  membrane protein-like protein  46.43 
 
 
149 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2969  Protein of unknown function DUF1616  33.33 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.555257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>