122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_184 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  8e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  73.14 
 
 		 176 aa  266  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  49.1 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  47.37 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  47.37 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  42.86 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  44.19 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  42.29 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  43.02 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  45.12 
 
 		 319 aa  151  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  43.02 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  42.44 
 
 		 174 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  41.86 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  41.67 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  41.28 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  43.21 
 
 		 318 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  43.83 
 
 		 318 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  45.27 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  43.98 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  40.12 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  38.6 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  39.16 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  40.24 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  41.91 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  37.29 
 
 		 375 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  38.6 
 
 		 601 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  40.74 
 
 		 347 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  31.75 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  35.76 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  37.21 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  32.35 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  37.58 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  37.72 
 
 		 191 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  30.86 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  30.86 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  30.86 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  36.97 
 
 		 194 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  36.57 
 
 		 220 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  32.1 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  31.48 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  30.86 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  30.86 
 
 		 169 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  30.99 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  30.41 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  35.85 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  33.33 
 
 		 406 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  32.04 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  29.82 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  29.82 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  29.01 
 
 		 167 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  36.05 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  38.36 
 
 		 170 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  32.35 
 
 		 347 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  34.84 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  34.88 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  34.15 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  33.74 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  31.17 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  32.1 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  37.34 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  34.16 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  33.13 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  31.48 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  34.55 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.35 
 
 		 402 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  36.42 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  35.9 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  34.78 
 
 		 365 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  29.59 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  37.2 
 
 		 211 aa  77.4  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  31.71 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  30.63 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  31.29 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  30.32 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  32.1 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  33.79 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  33.33 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1356  protein of unknown function UPF0157  30.57 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  30.86 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  29.41 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3527  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00787639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1247  protein of unknown function UPF0157  31.18 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  33.08 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  28.89 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  29.83 
 
 		 430 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02587  hypothetical protein  34.65 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  25.49 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  24.84 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  26.26 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3368  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.38 
 
 		 392 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>