More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_144 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  88.79 
 
 		 581 aa  1023    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  90.86 
 
 		 581 aa  1053    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  100 
 
 		 581 aa  1162    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 		 593 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 592 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 584 aa  337  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 594 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 581 aa  334  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 589 aa  320  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  35.37 
 
 		 591 aa  309  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 587 aa  306  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 608 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 597 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  38.11 
 
 		 537 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 591 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 585 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 489 aa  280  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 608 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 590 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 590 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 392 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 611 aa  276  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  28.97 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 609 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  33.07 
 
 		 575 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 444 aa  272  9e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  32.09 
 
 		 571 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 624 aa  266  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 456 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 608 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  31.7 
 
 		 571 aa  263  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  30.1 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  28.97 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  28.97 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  28.97 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  30.46 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 613 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  28.81 
 
 		 613 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 591 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  28.31 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  28.31 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 430 aa  257  5e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 596 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 399 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 607 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 585 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 597 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 602 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.24 
 
 		 582 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  28.74 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 604 aa  240  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 621 aa  240  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 612 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  30.73 
 
 		 591 aa  237  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.57 
 
 		 587 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 591 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 621 aa  237  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  28.98 
 
 		 587 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 585 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  28.98 
 
 		 587 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  30.41 
 
 		 591 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  30.41 
 
 		 591 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 608 aa  236  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  27.71 
 
 		 608 aa  236  9e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  30.4 
 
 		 591 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  30.4 
 
 		 591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  28.4 
 
 		 587 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  30.4 
 
 		 591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  27.01 
 
 		 610 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  28.57 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  30.4 
 
 		 591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 600 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 623 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.24 
 
 		 587 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  28.4 
 
 		 587 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  28.81 
 
 		 587 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 614 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 571 aa  231  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 615 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 591 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>