261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1425 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  29.63 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  42.22 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  34.02 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  32.29 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  32.29 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  37.33 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  38.03 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4073  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3960  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0087  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.383416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  24.83 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  25.88 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  29.9 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>