More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1412 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
737 aa  1527    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  39.84 
 
 
1379 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  43.04 
 
 
1258 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.88 
 
 
1258 aa  425  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
1262 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  45.61 
 
 
1092 aa  419  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
804 aa  301  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
819 aa  293  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.67 
 
 
819 aa  292  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
801 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
842 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.22 
 
 
952 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
844 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.55 
 
 
882 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
953 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
893 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  36.18 
 
 
852 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1079 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
962 aa  220  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  37.67 
 
 
912 aa  220  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  35.79 
 
 
853 aa  219  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33 
 
 
1062 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
852 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 
695 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  34.44 
 
 
1061 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
1134 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
1168 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
652 aa  210  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
670 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.57 
 
 
1255 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
673 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 
822 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1309 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
1106 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
395 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 
394 aa  201  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  39.05 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
769 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
1134 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 
642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
495 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1184 aa  196  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1222 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5744  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
510 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.739341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
661 aa  194  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
794 aa  193  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
848 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1034 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
651 aa  192  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  28.71 
 
 
1112 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
1247 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 
1260 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
644 aa  190  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 
990 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
583 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
660 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
643 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1418 aa  188  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 
850 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
774 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1194 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
850 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
1184 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
1428 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1039 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1275 aa  185  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 
657 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
1148 aa  185  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
1260 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
796 aa  184  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2766  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 
717 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.947572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
662 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
614 aa  183  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1655  sensory box histidine kinase/response regulator  32.65 
 
 
824 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
505 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1171  histidine kinase  27.26 
 
 
527 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00415214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 
655 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1132 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
653 aa  180  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  28.74 
 
 
844 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  26.9 
 
 
1268 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.81 
 
 
720 aa  179  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
1019 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
522 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 
653 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.6 
 
 
720 aa  178  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0666  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
831 aa  178  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
793 aa  178  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.26 
 
 
796 aa  178  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
639 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1076 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  30.98 
 
 
887 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
630 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 
1509 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
650 aa  177  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 
846 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
817 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 
885 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
765 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>