66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1384 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  100 
 
 
245 aa  503  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  87.19 
 
 
248 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  53.81 
 
 
242 aa  271  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  54.66 
 
 
242 aa  270  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  54.66 
 
 
242 aa  270  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  48.54 
 
 
250 aa  237  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  51.28 
 
 
288 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  46.86 
 
 
250 aa  230  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  46.93 
 
 
572 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  35.94 
 
 
217 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  35.94 
 
 
217 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  33.66 
 
 
210 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  32.51 
 
 
223 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  32.35 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  31.75 
 
 
226 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  32.35 
 
 
232 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  31.37 
 
 
227 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  34.5 
 
 
223 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  32.82 
 
 
217 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  26.25 
 
 
244 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  29.22 
 
 
244 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  31.39 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  30.35 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  33.33 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  28.1 
 
 
221 aa  92  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  31.75 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  31.38 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  30.34 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.55 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  28.02 
 
 
222 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  28.71 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  30.14 
 
 
227 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  26.57 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  30.43 
 
 
242 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  30.65 
 
 
223 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.67 
 
 
223 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  27.8 
 
 
240 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.56 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  30.35 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  30.66 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  29.9 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  28.83 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  28.71 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  29.95 
 
 
241 aa  82  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  28.27 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  26.19 
 
 
231 aa  82  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  29.7 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  28.22 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  26.67 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  25 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  25 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  23.18 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  24.57 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  27.14 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  26.79 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  26.29 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.23 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  29.35 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  28.37 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  26.32 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  23.74 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  19.46 
 
 
652 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  22.8 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.37 
 
 
201 aa  47  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.37 
 
 
201 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1999  hypothetical protein  34.85 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>