54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1298 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  100 
 
 		 732 aa  1511    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  61.12 
 
 		 701 aa  743    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  38.67 
 
 		 518 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  35.2 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  39.35 
 
 		 430 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  32.17 
 
 		 410 aa  191  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  36.44 
 
 		 429 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  34.53 
 
 		 571 aa  188  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  34.9 
 
 		 848 aa  188  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  36.08 
 
 		 443 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  32.52 
 
 		 383 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  38.91 
 
 		 590 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  36.99 
 
 		 867 aa  173  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  34.02 
 
 		 746 aa  164  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  36.51 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  34.59 
 
 		 868 aa  152  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  34.59 
 
 		 868 aa  152  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  34.59 
 
 		 868 aa  152  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  44.19 
 
 		 738 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  34.02 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  36.02 
 
 		 756 aa  117  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  33.51 
 
 		 277 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  34.33 
 
 		 880 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  32.47 
 
 		 725 aa  91.3  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  30.24 
 
 		 718 aa  83.2  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.04 
 
 		 731 aa  67  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  35.53 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  26.58 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  34.21 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  30.66 
 
 		 682 aa  60.1  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  43.02 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  27.22 
 
 		 834 aa  56.6  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  32.47 
 
 		 712 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  31.48 
 
 		 716 aa  55.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  33.12 
 
 		 712 aa  54.3  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  32.47 
 
 		 720 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  29.7 
 
 		 760 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  31.76 
 
 		 719 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  31.82 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  31.82 
 
 		 712 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  27.36 
 
 		 765 aa  51.6  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  26.67 
 
 		 759 aa  50.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  27.66 
 
 		 841 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  30.25 
 
 		 350 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  24.29 
 
 		 838 aa  47.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_002950  PG1533  TOPRIM domain-containing protein  26.62 
 
 		 682 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  32.61 
 
 		 930 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0321  hypothetical protein  27.7 
 
 		 444 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  24.62 
 
 		 631 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  28.49 
 
 		 272 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  25.43 
 
 		 979 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  26.29 
 
 		 895 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  27.27 
 
 		 575 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  31.62 
 
 		 755 aa  44.3  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>