53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1287 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  60.25 
 
 		 732 aa  719    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1441    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  39.71 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  35.61 
 
 		 475 aa  204  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  38.87 
 
 		 430 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  37.17 
 
 		 848 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16940  hypothetical protein  35.18 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1450  hypothetical protein  36.93 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1212  putative phiRv2 prophage protein  31.89 
 
 		 410 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  40.78 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  37.22 
 
 		 867 aa  167  8e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4162  hypothetical protein  34.22 
 
 		 429 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.363234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  46.23 
 
 		 738 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  34.87 
 
 		 746 aa  161  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0174  hypothetical protein  29.83 
 
 		 383 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  37.6 
 
 		 815 aa  150  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  32.95 
 
 		 868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  32.95 
 
 		 868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  32.95 
 
 		 868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  37.8 
 
 		 756 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  40.74 
 
 		 437 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  31.93 
 
 		 277 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  30.5 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.69 
 
 		 880 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  27.87 
 
 		 718 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  43.01 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  30.89 
 
 		 682 aa  60.1  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  30.12 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  31.34 
 
 		 731 aa  58.5  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  30.2 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  30.36 
 
 		 719 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2298  hypothetical protein  40 
 
 		 270 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  26.05 
 
 		 741 aa  53.9  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  32.9 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  24.87 
 
 		 834 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  32.28 
 
 		 712 aa  51.6  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  31.65 
 
 		 716 aa  51.2  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0321  hypothetical protein  31.58 
 
 		 444 aa  51.2  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  25.66 
 
 		 979 aa  50.8  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  33.33 
 
 		 720 aa  50.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  32.26 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  32.26 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  30.43 
 
 		 760 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  27.13 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  26.09 
 
 		 631 aa  47.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  26.17 
 
 		 765 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.65 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  24.7 
 
 		 895 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  29.85 
 
 		 759 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  27.45 
 
 		 930 aa  45.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  24.35 
 
 		 841 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  29.9 
 
 		 573 aa  44.3  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  30.25 
 
 		 755 aa  43.9  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>