More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1164 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  95.73 
 
 		 515 aa  1023    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  100 
 
 		 515 aa  1058    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2309  L-aspartate oxidase  55.42 
 
 		 507 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0753  L-aspartate oxidase  46.42 
 
 		 542 aa  477  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0164  L-aspartate oxidase  46.78 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1873  L-aspartate oxidase  48.56 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2355  L-aspartate oxidase  47.85 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.730681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00630  L-aspartate oxidase  47.89 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0122  L-aspartate oxidase  49.22 
 
 		 538 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.028832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  47 
 
 		 522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0105  L-aspartate oxidase  46.62 
 
 		 533 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0157  L-aspartate oxidase  47.95 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204171  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  45.03 
 
 		 538 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  46.41 
 
 		 534 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2445  L-aspartate oxidase  44.32 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  44.55 
 
 		 533 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  42.8 
 
 		 535 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1770  L-aspartate oxidase  43.39 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00592251  hitchhiker  0.000779121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3706  L-aspartate oxidase  42.62 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3632  L-aspartate oxidase  42.43 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  43.07 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0012  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  44.36 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1881  L-aspartate oxidase  43.28 
 
 		 550 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.756332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3159  L-aspartate oxidase  43.05 
 
 		 534 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  43.18 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  44.96 
 
 		 538 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  44.96 
 
 		 538 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1270  L-aspartate oxidase  43.85 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0349  L-aspartate oxidase  44.77 
 
 		 576 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1322  L-aspartate oxidase  41.9 
 
 		 532 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0392  L-aspartate oxidase  43.49 
 
 		 565 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2531  L-aspartate oxidase  43.9 
 
 		 516 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8381  L-aspartate oxidase  44.85 
 
 		 557 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.613382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0605  L-aspartate oxidase  42.46 
 
 		 579 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0449  L-aspartate oxidase  43.25 
 
 		 556 aa  391  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1827  L-aspartate oxidase  41.93 
 
 		 531 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0702  L-aspartate oxidase  43.34 
 
 		 531 aa  386  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000765394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 531 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1954  L-aspartate oxidase  42.37 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1743  L-aspartate oxidase  44.34 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1648  L-aspartate oxidase  41.67 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31990  L-aspartate oxidase  44.06 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1047  L-aspartate oxidase  42.91 
 
 		 537 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4381  L-aspartate oxidase  42.38 
 
 		 535 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1736  L-aspartate oxidase  41.23 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0462  L-aspartate oxidase  46.11 
 
 		 575 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13650  L-aspartate oxidase  42.57 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1141  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 536 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0257897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  43.85 
 
 		 863 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0729  L-aspartate oxidase  41.91 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000384944  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1030  L-aspartate oxidase  42.56 
 
 		 536 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0868483  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0525  L-aspartate oxidase  42.94 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.191357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0858  L-aspartate oxidase  42.75 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  42.58 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4280  L-aspartate oxidase  45.3 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0950  L-aspartate oxidase  41.63 
 
 		 532 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1426  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  45.16 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  44.55 
 
 		 867 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2735  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 		 528 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0636  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 		 609 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1874  L-aspartate oxidase  41.62 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1812  L-aspartate oxidase  42.64 
 
 		 531 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1236  L-aspartate oxidase  42.23 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.305386  hitchhiker  0.0000186096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2336  L-aspartate oxidase  41.8 
 
 		 533 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4563  L-aspartate oxidase  41.47 
 
 		 509 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2872  L-aspartate oxidase  42.53 
 
 		 535 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.689493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4295  L-aspartate oxidase  42.5 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0695  L-aspartate oxidase  43.19 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0723  L-aspartate oxidase  43.19 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223761  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2322  L-aspartate oxidase  43.35 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1066  L-aspartate oxidase  42.31 
 
 		 534 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4225  L-aspartate oxidase  41.73 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4175  L-aspartate oxidase  41.28 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00304289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0565  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.222565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  40.3 
 
 		 550 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  41.95 
 
 		 537 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  41.84 
 
 		 539 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2855  L-aspartate oxidase  42.18 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2937  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 537 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.320984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3033  L-aspartate oxidase  41.98 
 
 		 537 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625398  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_002950  PG1576  L-aspartate oxidase  42.44 
 
 		 518 aa  371  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  44.95 
 
 		 847 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1341  L-aspartate oxidase  42.18 
 
 		 537 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4327  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000167292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4164  L-aspartate oxidase  40.7 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3119  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2096  L-aspartate oxidase  43.95 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4662  L-aspartate oxidase  40.89 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0290416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1238  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1194  L-aspartate oxidase  41.79 
 
 		 537 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0198  L-aspartate oxidase  43.87 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4759  L-aspartate oxidase  41.74 
 
 		 538 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0687  L-aspartate oxidase  41.25 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.258293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1773  L-aspartate oxidase  45.29 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0853691  normal  0.2283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0242  aspartate oxidase  40.98 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.032501  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0815  L-aspartate oxidase  42.83 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1114  L-aspartate oxidase  43.75 
 
 		 529 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>