16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1138 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1168  hypothetical protein  86.17 
 
 		 535 aa  926    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000338543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1138  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1062    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000071313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1356  hypothetical protein  36.96 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0416655  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1137  hypothetical protein  36.59 
 
 		 375 aa  93.6  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000122751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1167  hypothetical protein  38.62 
 
 		 375 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000587842  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1355  hypothetical protein  29.27 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00651759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  32.92 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  32.92 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  32.92 
 
 		 541 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  31.82 
 
 		 547 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  30.3 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  31.06 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1184  hypothetical protein  28.57 
 
 		 639 aa  50.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  31.06 
 
 		 547 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3312  putative lipoprotein  28 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0728256  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  44.68 
 
 		 482 aa  43.5  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>